بخش پزشکی هسته‌ای بیمارستان هاشمی رفسنجانی یکی از مجهزترین مراکز ارائه خدمات تخصصی در کشور است که با استفاده از تکنولوژی‌های پیشرفته و تیمی مجرب از متخصصین، خدمات متنوعی در زمینه تشخیص و درمان بیماری‌ها ارائه می‌دهد. این بخش با بهره‌گیری از دستگاه‌های پیشرفته SPECT-CT (NM/CT 870 DR)  و PET-CT (Discovery MI)  توانسته است دقت و کیفیت خدمات خود را به سطحی بین‌المللی برساند.